狗芯片可以查到什么信息?
在讨论芯片之前,先简单介绍一个背景知识:现在给宠物做基因检测,一般有2种思路,一种是通过外部测序(外显子组测序或者全基因组测序)分析已知遗传病风险,另一种是利用SNP芯片或者下一代测序技术分析基因型,评估遗传多态性,进而确定是否存在基因突变的风险。 这两种方法各有利弊,芯片和测序都是目前较为先进的方法,能够从数量上和分析精度上提供大量的基因型数据。
由于基因检测的目的不同,因此选择的芯片或测序策略也各不相同。 对于幼龄动物(尤其是犬猫等),一般通过芯片检测分析60个左右的基因,从而得出5-10个潜在的遗传缺陷风险。而对于成年动物,由于体内细胞新陈代谢较快,基因型发生变化的几率较大,通常需要高通量测序来获取更多的遗传变异信息。 但无论采用哪种技术,遗传育种和基因检测的最终目的都是一致的——帮助人们通过基因层面认识动物个体间遗传差异的存在以及这种差异对动物生产性能或其他生长性状的影响。 回到问题中来,如果给狗狗做了芯片植入,能够通过它查出哪些信息呢?其实,芯片中只是记录了基因型的检测结果,而真正影响动物表现(生长、繁殖、疾病敏感性等)的基因突变信息,还需要结合表型数据进行进一步综合分析才能得出。
不过,虽然芯片只能检测到单一基因型的序列,但是作为已经商业化生产的商品,芯片中的序列是经过特别设计的,能够提供检测动物某些特定性状的可观测遗传变异信息。 目前,应用于动物行业的芯片主要有两种类型:一种是含有60个碱基对的微阵列芯片,由美国Affinity生物技术有限公司研发;另一种是包含约300个核苷酸的短片段核酸分子探针,由英国Oxgene公司研制。 以Affinity芯片为例,虽然其检测的基因数较少,但每个基因检测的位点数较多,共含有64个检测位点,可检出单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)及小片段缺失/插入。由于人类基因大多含有突变,因此用该芯片也可以检测人类基因型的突变情况。
另外,对于新引进的动物物种,还可以将其与国内品种进行比较,找出差异,检测可能存在的致病基因。值得注意的是,这种芯片不仅可以检测家养动物基因型,也能够检测寄生虫基因型。 在实际应用过程中,通常根据客户的需要对芯片进行检测。如果是用于引种和繁育的雌雄性各一只动物,就可以完全反映一个群体的遗传结构,从而为育种工作提供依据。但如果需要对一批动物进行遗传评定,则需要随机选取若干只动物,同时确保雌雄均有样本,才能保证结果的准确性。 如果想要了解自己的爱宠是否是纯种,是否带有遗传疾病风险,也可以给它做个基因检测哦~